1、审计业务和审阅业务的区别主要是：目标不同。财务报表审计的目标是：注册会计师通过执行审计工作，对财务报表的下列方面发表审计意见：财务报表是否按照适用的会计准则和相关会计制度的规定编制；财务报表是否在所有重大方面公允反映被审计单位的财务状况、经营成果和现金流量。财务报表审阅的目标是：注册会计师在实施审阅程序的基础上，说明是否注意到某些事项，使其相信财务报表没有按照适用的会计准则和相关会计制度的规定编制，未能在所有重大方面公允反映被审阅单位的财务状况、经营成果和现金流量。
2、业务性质不同。财务报表审计属于合理保证的鉴证业务；财务报表审阅属于有限保证的鉴证业务。
3、执业标准不同。财务报表审计是根据《中国注册会计师审计准则》的规定进行审计；财务报表审阅是根据《中国注册会计师审阅准则第2101号——财务报表审阅》的规定进行审阅。
4、所使用的程序和方法不同。财务报表审计程序的实施范围较广，程度较深，种类较多，包括检查记录或文件、检查有形资产、观察、询问、函证、重新计算、重新执行、分析程序等。财务报表审阅以询问和分析程序为主，只有当有理由相信所审阅的财务报表可能存在重大错报时才需要追加其他程序。
5、注册会计师提供的保证程度不同。财务报表审计以积极方式提供合理保证；财务报表审阅以消极方式提供有限保证。
6、结论的类型不同。财务报表审计的意见类型有无保留意见、保留意见、否定意见、无法表示意见4种，其中无保留意见和保留意见可以加强调事项段；财务报表审阅类似于审计意见的类型，包括无保留、保留、否定、无法提供任何保证4种。